Jucătorii care joacă "EteRNA" doar bate știința profesională la această descoperire crucială

Știința cetățenilor tocmai a urmat nivelul următor: jucătorii video au făcut o descoperire biologică și au fost publicați de un jurnal științific revizuit de colegi.

Publicat în această săptămână în Jurnalul de Biologie Moleculară, o serie de reguli intuitiv dezvoltate pentru cât de dificilă va fi o formă specială prin proiectarea ARN. Ei au descoperit, de exemplu, că o formă mai simetrică este, cu atât mai greu va fi să proiectăm un șir de ARN pentru a se potrivi cu ea.

Colectivitatea jucătorilor video a făcut descoperirea prin joc, Eterna, un joc care provoacă jucătorilor să ia fire de ARN și să le plize într-o formă dorită prin modificarea machiajului lor chimic. Problema științifică a ARN-ului pliabil într-o formă particulară este complexă, dar jocul nu este - nu este necesară înțelegerea biochimiei pentru a începe să se joace.

Jucătorii au preluat întrebarea de cercetare din proprie inițiativă, ca o modalitate de a oferi instrucțiuni mai noi jucătorilor pentru a judeca dificultatea relativă a diferitelor puzzle-uri. Constatarile vor ajuta la orientarea viitoare de cercetare biomedicala, deoarece noul set de norme ofera oamenilor de stiinta un sentiment mai bun daca incercarea sau nu de a arunca ARN intr-o forma data este un exercitiu inutil.

Aceasta cercetare sugereaza ca paradigma standard de crowdsourcing stiintifice poate fi flipped, Rhiju Das, un profesor de biochimie la Stanford, spune Invers într-un e-mail. Eterna a fost lansat în 2011 de către Das și Adrien Treuille, profesor asistent de informatică la Universitatea Carnegie Mellon. „ Eterna jucătorii își pot crea propriile întrebări de cercetare și își pot scrie propriile lucrări. În cadrul acestei cercetări, au existat câteva îndrumări și teste independente de la experții din laboratorul meu."

ARN-ul sintetizat deține un potențial incredibil pentru o nouă generație de medicamente și terapii medicale. Dacă poate fi pliată în forma corectă, ARN poate fi construit pentru a viza anumite virusuri, cancere și chiar tulburări genetice. CRISPR, un proces de editare a genei care ar putea modifica dramatic viitorul existenței umane, utilizează ARN pentru a ghida enzima de tăiere a ADN-ului, Cas9, la secțiunea nedorită a ADN-ului.

Eterna a inceput ca un forum pentru oamenii de stiinta de la experti pentru a prezenta puzzle-uri pentru jucatori, dar de atunci a crescut dincolo de asta. Jocul și cei 100.000 de jucători înregistrați acum există într-o relație simbiotică și evolutivă cu oameni de știință profesioniști și modele de calculatoare construite pentru a proiecta și a testa structura ARN.

"Modelare și Eterna nu sunt exclusive ", spune Das. „ Eterna reunește o mulțime de oameni, dintre care unii scriu propriile modele de computere ".

În lucrarea actuală, jucătorii au scris în mod colaborativ scripturi pentru a-și testa ideile pentru ceea ce face ca structurile ARN să fie greu de proiectat. Das spune că unii jucători i-au spus că sunt deosebit de entuziasmați să-și automatizeze ideile în modele de computere, pentru că vor să continue și să rezolve probleme mai grele.

Probleme create de Eterna jucătorii merg în realitate să fie sintetizați în laboratorul lui Das - până în prezent 86459 de secvențe generate de jucător au fost construite IRL.

Principalii autori ai lucrării au fost Eterna jucătorii Jeff Anderson-Lee, Eli Fisker, Vineet Kosaraju și Michelle Wu. Wu este de asemenea un doctorat. student în informatică biomedicală la Stanford.

În viitor, ar putea fi faptul că experții cetățeni încep să publice descoperirile științifice complet independent.

"Acest șablon pentru știința cetățeanului ar putea fi util pentru alte proiecte și domenii ale științei, cum ar fi astronomia (Galaxy Zoo) sau identificarea speciei provenind din mulțime (Codul de bare) ", Spune Das. "Mai ales dacă, cum ar fi Eterna, văd blocajele în stadiul de scriere a hârtiei."